O cliente FTP Filezilla pode ser baixado em: http://filezilla-project.org/download.php
Ele irá te auxiliar no gerenciamento de dados em sua conta de hospedagem.
Após baixar e instalar, execute o programa.
Na barra superior complete os dados
Host: ftp.seudominio
Nome de Usuário: seu usuário cpanel
Senha: sua senha cpanel
Porta: 21 (padrão)
Para finalizar a conexão, clique em "Conexão Rápida".
A pasta para qual terá de enviar seus arquivos de seu website, será por padrão "public_html".